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215002 Bioquímica 2024/25Grado en Medicina, Universidad de Alcalá

Grado en Medicina, 1.er curso, 1.er cuatrimestre.

pdfGuía docente de la asignatura.

Documentos de la facultad:

Esta es la página de apoyo para la parte de asignatura que imparte el profesor Angel Herráez.
      Puedes contactar con él por correo electrónico:

Tareas para antes de acudir a clase

tareas
para el día tema tarea
lunes 30 sep. 7 Leer del apartado III del tema 9 de Marks las pp.151-154 digital (140-143 en papel). Traer dudas a clase.
lunes 30 sep. 7 Hacer el ejercicio sobre determinación de parámetros cinéticos de una enzima (disponible en AV), traer a clase el resultado para su discusión
Leer apdo. 9.II (pp.148-150 digital) de Marks
jueves 26 sep. 7 Leer sobre la clasificación de la comisión de enzimas en Marks pp.141-144 digital (final del cap. 8) "Comentarios bioquímicos".
Leer sobre sitio activo, sitio de unión y estado de transición en Marks pp.125-127 (Cap.8)
jueves 26 sep. 7 Leer sobre la clasificación de la comisión de enzimas en Marks pp.141-144 digital (final del cap. 8) "Comentarios bioquímicos".
miércoles 25 sep. 6 Leer el csso clínico de intoxicación por monóxido de carbono (pdf en Aula Virtual, seminario S6B), anotar cualquier duda, algo que pareca erróneo, algo que no entendáis... para discutirlo en clase el día 27.
martes 24 sep. 6 Practicar con Simulación de la saturación con oxígeno y revisar las animaciones de la transición T ↔ R en la hemoglobina (cambio conformacional)
lunes 23 sep. 6 Leer Marks, cap.7-VII, pp. 108-111
lunes 23 sep. 5 Leer Marks, (cap. 45) pp.859-860 y (cap. 7) pp.111-113.
viernes 20 sep.  

Repasar los conceptos de estructura primaria y secundaria.

Leer los fundamentos de electroforesis y de cromatografía aplicadas a la separación de biomoléculas

miércoles 18 sep. 4 Estudiar e. primaria y secundaria en Marks (pp. 100-104) y en Biomodel-1
martes 17 sep. 4

Leer Marks, cap. 7: pp. 100-104
Descargar el recortable de hélice alfa y lámina beta, imprimirlo (preferiblemente en papel grueso o cartulina delgada) y montarlo; anotar dificultades o dudas

lunes 16 sep. 3 Estudiar las estructuras de los 21 aminoácidos proteinogénicos (20 clásicos + selenocisteína):
reconocimiento de sus grupos funcionales, su carga y su polaridad. (Haremos ejercicios de seminario)
viernes 13 sep. 3

Repasar los conceptos de polaridad y enlaces débiles (tema 2)
Traer a clase copia impresa de la hoja de estructuras de los aminoácidos que está disponible en Aula Virtual.
Leer y anotar dudas: McKee, introducción del cap. 5 (p. 110, acaba en 111) y cap. 5.3 (sólo pp. 126-127)

jueves 12 sep. 2

Intentad resolver (de nuevo) el ejercicio de bicarbonato en plasma (ahora disponible en Aula Virtual)
Leer y anotar dudas: Marks pp. 56-60 del libro electrónico (cap.4, apartados II.B, III, IV.A, IV.B)

miércoles 11 sep. 2 Leer y anotar cualquier duda: Marks pp. 53-56 del libro electrónico (cap.4, apartados I.A, I.B, II, II.A, II.B)

Los contenidos y fechas son estimativos; se van confirmando poniéndoles la marca

más Tema 1 - Introducción

Concepto y perspectivas de la Bioquímica. Composición química de los seres vivos.

9 septiembre (Presentación de la asignatura y Tema 1)

Biomoléculas y sus diferentes grados de complejidad: página

enlace La escala del universo

sonido“Bioquímica de andar por casa” - programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa)

enlace Vídeos del concurso "Cuéntaselo a tus padres" enlacemás

Un concurso de divulgación científica organizado por SEBBM. Dcenas de estudiantes han producido vídeos para explicar distintos conceptos científicos de una manera amena, y rigurosa, abriendo así la ciencia a la sociedad.

página Ciencia para todos - Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular

más Tema 2 - Agua y pH en los seres vivos

El agua como medio biológico. pH y tampones fisiológicos.

10, 11, 12 sept.

Guía de los contenidos:

Bibliografía:

  • Marks cap. 4

más Tema 3 - Proteínas (introducción)

Estructura y función de proteínas. Estructuras de los aminoácidos. Propiedades de las proteínas.

13, 13, 16 sept.

Guía de los contenidos:

Bibliografía:

  • Marks, cap.6

Bilbliografía alternativa:

  • McKee, cap.5, 5.1
  • Baynes, cap. 2

Contenidos relacionados:

Práctica 1: Valoración de proteínas por el método de Lowry.
Este método para medir concentración de una mezcla de proteínas se basa en una reacción en la que participan los residuos de tirosina.

Práctica 2: Separación e identificación de aminoácidos por cromatografía en capa fina.
Este método de separación y análisis de una mezcla de aminoácidos se basa en la polaridad de cada uno de los aminoácidos, y en su detección a través de una reacción con el grupo amino alfa.

Ejercicios y actividades de estudio:

pdfCrucigrama para practicar los nombres y propiedades de los aminoácidos.

modelos Estructura de los aminoácidos en 3D, adaptado para el móvil y con autoevaluación.

más Tema 4 - Estructura de las proteínas (I)

Estructura primaria de las proteínas: enlace peptídico. Estructura secundaria de las proteínas: hélice alfa, lámina beta, bucles y giros. Estructuras supersecundarias.

17, 18 sept.

Guía de los contenidos:

Bilbliografía:

Bibliografía alternativa:

  • McKee, cap. 5.1, 5.2, 5.3

Material de apoyo:

animación Biomodel: animaciones de los niveles estructurales en proteínas y del efecto hidrófobo

pdf modelo recortable en papel para construir una hélice alfa y una lámina beta

más Tema 5 - Estructura de las proteínas (II)

Estructura terciaria y cuaternaria de las proteínas. Estructuras supersecundarias. Proteínas fibrosas: colágeno, elastina y queratinas. Proteínas globulares. Proteínas plasmáticas e inmunoglobulinas. Fuerzas que estabilizan la estructura tridimensional de las proteínas. Plegamiento, desnaturalización y renaturalización.

19, 20, 20, 23◤ sept.

Guía de los contenidos:

Bibliografía:

Contenidos relacionados:

Práctica 4: Cromatografía de exclusión molecular (o filtración en gel). (También con tema 6)
Este tipo de cromatografía separa las proteínas globulares, en su conformación nativa, de acuerdo a su tamaño.

más Tema 6 - Mioglobina y hemoglobina

Mioglobina y hemoglobina. Estructura y función. Modulación de la afinidad de la hemoglobina por el oxígeno: cooperatividad y alostería.

23◢, 24, 24, 25 sept.

Guía de los contenidos: página

Contenidos relacionados:

Práctica 4: Cromatografía de exclusión molecular (o filtración en gel). Interconversión de las formas de la hemoglobina.
En este experimento se puede observar la conversión entre diferentes formas de la hemoglobina: con o sin O2 unido, con Fe2+ o con Fe3+.

Bibliografía:

Ejercicios

  • página Discusión de casos. (Opcional, para explorar por vuestra cuenta)
  • página Ejercicios nº1 (con respuestas)

más Temas 7 y 8 - Enzimas y regulación de su actividad

Concepto, clasificación y nomenclatura de las enzimas. Conceptos de coenzima, centro activo y especificidad. Mecanismo de la catálisis enzimática. Cinética enzimática. Reacciones enzimáticas con un solo sustrato: modelo de Michaelis y Menten. Linealización de la ecuación. Inhibición de las enzimas.
Regulación de la actividad enzimática: su necesidad. Reacción limitante. Regulación por modificación de la cantidad de enzima. Regulación por modificación de la eficiencia catalítica: zimógenos, modificación covalente, enzimas alostéricas. Isoenzimas.

26, 27, 27, 30, 30 sept.

Guía de los contenidos: página

Contenidos relacionados:

Práctica 3: Estudio cinético de la fosfatasa alcalina.
En esta práctica se aprende a medir la actividad de una enzima (a través de la velocidad de formación del producto de la reacción) y el diseño de un experimento para medir los parámetros cinéticos de la enzima según el modelo de Michaelis y Menten (constante de Michaelis y velocidad máxima)

Bibliografía y material de apoyo:

Marks, cap.8 y 9

página Esquemas animados sobre diversos aspectos de la acción enzimática (Biomodel)

Biomodel > metabolismo > enzimas

  • Como lectura interesante, un artículo del prof. Luis Franco: Enzimas: qué son y para qué sirven
    Luis Franco (2007) Rev.R.Acad.Cienc.Exact.Fís.Nat. (Esp) 101, 399-417 [VIII Programa de Promoción de la Cultura Científica y Tecnológica]
    Os he resaltado algunas frases especialmente importantes. Reproducido aquí con permiso de la editorial. Artículo original en RAC.

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios para afianzar los conceptos de actividad enzimática, concentración de actividad enzimática y actividad enzimática específica.

página Ejercicios sobre los contenidos de ambos temas, incluidas sus respuestas.

más Tema 9 - Glúcidos

Glúcidos: concepto y clasificación. Monosacáridos y derivados. Oligosacáridos. Polisacáridos y glucoconjugados.

1, 2, 3◤ oct.

Guía de los contenidos: contenidos

Bibliografía y material de apoyo:

Marks cap.5: pp.69-72; cap.49: pp. 945-7 . Muy resumido; debéis completar con otro

Feduchi, cap. 2

McKee, cap. 7

Estructuras 3D en Biomodel-3 y Biomodel-6

Ejercicios y actividades de estudio:

pdfCrucigrama de terminología. Respuestas

página Ejercicios de glúcidos. (con respuestas)

página Ejercicios de nomenclatura de glúcidos. (con autoevaluación)

Contenidos relacionados:

Prácticas 5 y 6: Aislamiento de glucógeno y cuantificación en forma de glucosa mediante una reacción enzimática.
En esta práctica se comprende cómo se diseña un método de purificación de biomoléculas, basado en sus propiedades, la hidrólisis del glucógeno para convertirse en glucosa libre y la determinación de la concentración de glucosa mediante un ensayo colorimétrico que emplea una enzima.

más Tema 10 - Lípidos

Concepto, clasificación, estructura, propiedades, distribución y funciones de los lípidos.

3◢, 4 oct.

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Marks cap.5: pp.72-75 Muy resumido; debéis completar con otro

Feduchi, cap. 3

McKee, cap. 11, pp. 358-375 (libro-e)

Estructuras 3D en Biomodel-3

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios sobre familas de lípidos: estructura y polaridad (con autoevaluación)

página Ejercicios de lípidos y membranas (con autoevaluación)

más Tema 11 - Membranas biológicas y transporte

Membranas biológicas: componentes, estructura, función y propiedades. Dominios funcionales. Transporte a través de membranas. Energética del transporte.

4 oct.

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Marks cap.10: pp. 165-172, 174

Biomodel-2 > Bicapa lipídica

Biomodel-2 > “El mundo de los lípidos” > Bicapas

más Tema 12 - Introducción al metabolismo

Introducción al metabolismo. Termodinámica de los sistemas biológicos. Compuestos ricos en energía. Oxidorreducción biológica. Cadena de transporte electrónico. Fosforilación oxidativa. Estructura y función de la ATP sintasa.

21, 22, 22, 23, 24 oct.

Guía de los contenidos: enlace

Bibliografía y material de apoyo:

Marks cap.19: Cap.19: pp.349-351, 353-360, 388-400

página Biomodel > Metabolismo > Transporte electrónico mitocondrial

sonido“Canción de la mitocondria” - programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa) 3 min

sonido“Mr. W's Electron Transport Chain” - vídeo + rap en inglés con subtítulos en inglés

vídeo Electron Transport Chain - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University

vídeo ATP synthase (gradients) - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University

vídeo Otras animaciones simples en Biomodel (en la parte inferior de la página)

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios de introducción al metabolismo, bioenergética, redox, transporte electrónico y fosforilación oxidativa. (con respuestas)

Ejercicios con autoevaluación:
página orden de intervención de los transportadores de electrones
página naturaleza de los transportadores de electrones

... A partir del tema 13, el material estará en el Aula Virtual ...

... El resto de temas se irán publicando progresivamente ...

Bibliografía

Es muy recomendable trabajar con un libro y no limitarse a las presentaciones o apuntes de clase.
Para el bloque de temas 1 a 12 seguiremos principalmente Marks y, en aspectos puntuales, McKee o Baynes; todos ellos están disponibles en formato electrónico desde ordenadores del campus y desde otros que se conecten mediante red privada virtual (VPN; ayuda para su uso). No obstante, cualquier texto de Bioquímica es válido para esta asignatura (consulta la bibliografía recomendada en la guia docente).

  • Lieberman, Marks, Peet - Bioquimica médica básica - un enfoque clínico, 4ª ed. (2013) Wolters Kluwer
    web Acceso al texto completo para UAH https://bit.ly/Marks_4 (eLibro)
  • McKee y McKee. Bioquímica: las bases moleculares de la vida, 5ª ed. (2014) McGraw Hill.
    web Acceso al texto completo para UAH https://bit.ly/McKee_5 (Ingebook)
  • Baynes y Dominiczak. Bioquímica médica, 6ª ed. (2024) Elsevier.
    web Acceso al texto completo para UAH https://bit.ly/Baynes_6 (ClinicalKey Student)
  • Feduchi, Romero, Yáñez, García-Hoz - Bioquímica- conceptos esenciales, 3ª ed. (2021) Panamericana
    web Acceso al texto completo para UAH https://bit.ly/Feduchi_3 (Eureka)

Otros:

  • Acceso a libros electrónicos desde la Biblioteca UAH.
  • Nomenclatura: recomendaciones de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB) para compuestos orgánicos y bioquímicos, símbolos, terminología, etc.
  • websede web Biomodel: complementos para el estudio de bioquímica y biología molecular.

Orientaciones para los trabajos

  • Pautas para la preparación y envío de trabajos escritos en formato electrónico.
  • Pautas para la preparación de trabajos escritos y presentaciones orales.
  • Orientaciones para escoger y citar fuentes bibliográficas.

Prácticas

Toda la información de prácticas se publicará en el Aula Virtual.