Grado en Medicina, 1.er curso, 1.er cuatrimestre.
Guía docente de la asignatura.
Documentos de la facultad:
Esta es la página de apoyo para la parte de asignatura que imparte el profesor Angel Herráez.
Puedes contactar con él por correo electrónico:
para el día | tema | tarea |
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lunes 30 sep. | 7 | Leer del apartado III del tema 9 de Marks las pp.151-154 digital (140-143 en papel). Traer dudas a clase. |
lunes 30 sep. | 7 | Hacer el ejercicio sobre determinación de parámetros cinéticos de una enzima
(disponible en AV), traer a clase el resultado para su discusión Leer apdo. 9.II (pp.148-150 digital) de Marks |
jueves 26 sep. | 7 | Leer sobre la clasificación de la comisión de enzimas en Marks pp.141-144 digital (final del cap. 8) "Comentarios bioquímicos". Leer sobre sitio activo, sitio de unión y estado de transición en Marks pp.125-127 (Cap.8) |
jueves 26 sep. | 7 | Leer sobre la clasificación de la comisión de enzimas en Marks pp.141-144 digital (final del cap. 8) "Comentarios bioquímicos". |
miércoles 25 sep. | 6 | Leer el csso clínico de intoxicación por monóxido de carbono (pdf en Aula Virtual, seminario S6B), anotar cualquier duda, algo que pareca erróneo, algo que no entendáis... para discutirlo en clase el día 27. |
martes 24 sep. | 6 | Practicar con Simulación de la saturación con oxígeno y revisar las animaciones de la transición T ↔ R en la hemoglobina (cambio conformacional) |
lunes 23 sep. | 6 | Leer Marks, cap.7-VII, pp. 108-111 |
lunes 23 sep. | 5 | Leer Marks, (cap. 45) pp.859-860 y (cap. 7) pp.111-113. |
viernes 20 sep. | Repasar los conceptos de estructura primaria y secundaria. Leer los fundamentos de electroforesis y de cromatografía aplicadas a la separación de biomoléculas |
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miércoles 18 sep. | 4 | Estudiar e. primaria y secundaria en Marks (pp. 100-104) y en Biomodel-1 |
martes 17 sep. | 4 | Leer Marks, cap. 7: pp. 100-104 |
lunes 16 sep. | 3 | Estudiar las estructuras de los 21 aminoácidos proteinogénicos (20 clásicos + selenocisteína): reconocimiento de sus grupos funcionales, su carga y su polaridad. (Haremos ejercicios de seminario) |
viernes 13 sep. | 3 | Repasar los conceptos de polaridad y enlaces débiles (tema 2) |
jueves 12 sep. | 2 | Intentad resolver (de nuevo) el ejercicio de bicarbonato en plasma (ahora disponible en Aula Virtual) |
miércoles 11 sep. | 2 | Leer y anotar cualquier duda: Marks pp. 53-56 del libro electrónico (cap.4, apartados I.A, I.B, II, II.A, II.B) |
Los contenidos y fechas son estimativos; se van confirmando poniéndoles la marca
Concepto y perspectivas de la Bioquímica. Composición química de los seres vivos.
9 septiembre (Presentación de la asignatura y Tema 1)
Biomoléculas y sus diferentes grados de complejidad:
“Bioquímica de andar por casa” - programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa)
Vídeos del concurso "Cuéntaselo a tus padres" más
Un concurso de divulgación científica organizado por SEBBM. Dcenas de estudiantes han producido vídeos para explicar distintos conceptos científicos de una manera amena, y rigurosa, abriendo así la ciencia a la sociedad.
Ciencia para todos - Sociedad Española de Bioquímica y Biología Molecular
El agua como medio biológico. pH y tampones fisiológicos.
10, 11, 12 sept.
Estructura y función de proteínas. Estructuras de los aminoácidos. Propiedades de las proteínas.
13, 13, 16 sept.
Práctica 1: Valoración de proteínas por el método de Lowry.
Este método para medir concentración de una mezcla de proteínas se basa en una reacción en la que participan los residuos de tirosina.
Práctica 2: Separación e identificación de aminoácidos por cromatografía en capa fina.
Este método de separación y análisis de una mezcla de aminoácidos se basa en la polaridad de cada uno de los aminoácidos, y en su detección a través de una reacción con el grupo amino alfa.
Crucigrama para practicar los nombres y propiedades de los aminoácidos.
Estructura de los aminoácidos en 3D, adaptado para el móvil y con autoevaluación.
Estructura primaria de las proteínas: enlace peptídico. Estructura secundaria de las proteínas: hélice alfa, lámina beta, bucles y giros. Estructuras supersecundarias.
17, 18 sept.
Biomodel: animaciones de los niveles estructurales en proteínas y del efecto hidrófobo
modelo recortable en papel para construir una hélice alfa y una lámina beta
Estructura terciaria y cuaternaria de las proteínas. Estructuras supersecundarias. Proteínas fibrosas: colágeno, elastina y queratinas. Proteínas globulares. Proteínas plasmáticas e inmunoglobulinas. Fuerzas que estabilizan la estructura tridimensional de las proteínas. Plegamiento, desnaturalización y renaturalización.
19, 20, 20, 23◤ sept.
Práctica 4: Cromatografía de exclusión molecular (o filtración en gel). (También con tema 6)
Este tipo de cromatografía separa las proteínas globulares, en su conformación nativa, de acuerdo a su tamaño.
Mioglobina y hemoglobina. Estructura y función. Modulación de la afinidad de la hemoglobina por el oxígeno: cooperatividad y alostería.
23◢, 24, 24, 25 sept.
Práctica 4: Cromatografía de exclusión molecular (o filtración en gel). Interconversión de las formas de la hemoglobina.
En este experimento se puede observar la conversión entre diferentes formas de la hemoglobina: con o sin O2 unido,
con Fe2+ o con Fe3+.
Concepto, clasificación y nomenclatura de las enzimas. Conceptos de coenzima, centro activo y especificidad. Mecanismo de la catálisis enzimática. Cinética enzimática. Reacciones enzimáticas con un solo sustrato: modelo de Michaelis y Menten. Linealización de la ecuación. Inhibición de las enzimas.
Regulación de la actividad enzimática: su necesidad. Reacción limitante. Regulación por modificación de la cantidad de enzima. Regulación por modificación de la eficiencia catalítica: zimógenos, modificación covalente, enzimas alostéricas. Isoenzimas.
26, 27, 27, 30, 30 sept.
Práctica 3: Estudio cinético de la fosfatasa alcalina.
En esta práctica se aprende a medir la actividad de una enzima (a través de la velocidad de formación del producto de la reacción) y el diseño de un experimento para medir los parámetros cinéticos de la enzima según el modelo de Michaelis y Menten (constante de Michaelis y velocidad máxima)
Marks, cap.8 y 9
Esquemas animados sobre diversos aspectos de la acción enzimática (Biomodel)
Biomodel > metabolismo > enzimas
Ejercicios para afianzar los conceptos de actividad enzimática, concentración de actividad enzimática y actividad enzimática específica.
Ejercicios sobre los contenidos de ambos temas, incluidas sus respuestas.
Glúcidos: concepto y clasificación. Monosacáridos y derivados. Oligosacáridos. Polisacáridos y glucoconjugados.
1, 2, 3◤ oct.
Marks cap.5: pp.69-72; cap.49: pp. 945-7 . Muy resumido; debéis completar con otro
Feduchi, cap. 2
McKee, cap. 7
Estructuras 3D en Biomodel-3 y Biomodel-6
Crucigrama de terminología. Respuestas
Ejercicios de glúcidos. (con respuestas)
Ejercicios de nomenclatura de glúcidos. (con autoevaluación)
Prácticas 5 y 6: Aislamiento de glucógeno y cuantificación en forma de glucosa mediante una reacción enzimática.
En esta práctica se comprende cómo se diseña un método de purificación de biomoléculas, basado en sus propiedades, la hidrólisis del glucógeno para convertirse en glucosa libre y la determinación de la concentración de glucosa mediante un ensayo colorimétrico que emplea una enzima.
Concepto, clasificación, estructura, propiedades, distribución y funciones de los lípidos.
3◢, 4 oct.
Marks cap.5: pp.72-75 Muy resumido; debéis completar con otro
Feduchi, cap. 3
McKee, cap. 11, pp. 358-375 (libro-e)
Estructuras 3D en Biomodel-3
Ejercicios sobre familas de lípidos: estructura y polaridad (con autoevaluación)
Membranas biológicas: componentes, estructura, función y propiedades. Dominios funcionales. Transporte a través de membranas. Energética del transporte.
4 oct.
Marks cap.10: pp. 165-172, 174
Biomodel-2 > Bicapa lipídica
Biomodel-2 > “El mundo de los lípidos” > Bicapas
Introducción al metabolismo. Termodinámica de los sistemas biológicos. Compuestos ricos en energía. Oxidorreducción biológica. Cadena de transporte electrónico. Fosforilación oxidativa. Estructura y función de la ATP sintasa.
21, 22, 22, 23, 24 oct.
Marks cap.19: Cap.19: pp.349-351, 353-360, 388-400
Biomodel > Metabolismo > Transporte electrónico mitocondrial
“Canción de la mitocondria” - programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa) 3 min
“Mr. W's Electron Transport Chain” - vídeo + rap en inglés con subtítulos en inglés
Electron Transport Chain - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University
ATP synthase (gradients) - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University
Otras animaciones simples en Biomodel (en la parte inferior de la página)
Ejercicios de introducción al metabolismo, bioenergética, redox, transporte electrónico y fosforilación oxidativa. (con respuestas)
Ejercicios con autoevaluación:
orden de intervención de los transportadores de electrones
naturaleza de los transportadores de electrones
Es muy recomendable trabajar con un libro y no limitarse a las presentaciones o apuntes de clase.
Para el bloque de temas 1 a 12 seguiremos principalmente Marks y, en aspectos puntuales, McKee o Baynes; todos ellos están disponibles en formato electrónico desde ordenadores del campus y desde otros que se conecten mediante red privada virtual (VPN; ayuda para su uso). No obstante, cualquier texto de Bioquímica es válido para esta asignatura (consulta la bibliografía recomendada en la guia docente).
Otros:
Orientaciones para los trabajos
Toda la información de prácticas se publicará en el Aula Virtual.