Novedades:

660012 Bioquímica 2023/24

Grado en Química, 2o curso, 2º cuatrimestre.

pdfGuía docente de la asignatura.

Documentos de la facultad:

Esta es la página de apoyo para la parte de asignatura que imparte el profesor Angel Herráez.
      Puedes contactar con él por correo electrónico:

Los contenidos y fechas son estimativos; se van confirmando poniéndoles la marca

Clases grabadas

sonidoAcceso a las grabaciones en el navegador o para descargar (mp3). (Sólo clases presenciales)

más Bibliografía

Es muy recomendable trabajar con un libro y no limitarse a las presentaciones o apuntes de clase.
Como texto principal sugerimos Feduchi o McKee; ambos están disponibles en formato electrónico desde ordenadores del campus y desde otros que se conecten mediante red privada virtual (VPN; ayuda para su uso). No obstante, cualquier texto de Bioquímica es válido para esta asignatura.

Otros:

Orientaciones para los trabajos

Prácticas

Toda la información sobre las prácticas está en el Aula Virtual.

más Tema 1 - La bioquímica: una ciencia en desarrollo

23 enero

Concepto y fines de la bioquímica. La diversidad biológica y la unidad bioquímica. Biomoléculas y sus diferentes grados de complejidad.

enlace La escala del universo

sonido“Bioquímica de andar por casa” - programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa)

enlace Vídeos del concurso "Cuéntaselo a tus padres" enlacemás

Un concurso de divulgación científica organizado por SEBBM. Dcenas de estudiantes han producido vídeos para explicar distintos conceptos científicos de una manera amena, y rigurosa, abriendo así la ciencia a la sociedad.

más Tema 3 - Estructura y función de proteínas

Funciones de las proteínas. Importancia biológica. Aminoácidos como unidades constituyentes. Estructura primaria. Enlace peptídico. Técnicas de secuenciación.

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 6

página Abreviaturas de 3 y 1 letra para los aminoácidos (definidas por IUPAC e IUBMB) y propiedades de los aminoácidos

modelos Estructura de los aminoácidos en 3D, en Biomodel-1

diagramaUna forma de agrupar los aminoácidos y sus propiedades (copia del diagrama interactivo en Biomodel-1)

Ejercicios y actividades de estudio:

pdfCrucigrama para practicar los nombres y propiedades de los aminoácidos.

modelos Estructuras en 3D, adaptado para el móvil y con autoevaluación.

más Tema 4 - Estructura tridimensional de las proteínas

Estructura secundaria: hélices alfa, láminas plegadas beta, bucles y giros. Fuerzas que estabilizan la estructura tridimensional. Estructura terciaria y cuaternaria. Plegamiento de proteínas. Técnicas de purificación y análisis.

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 7

pdf modelo recortable en papel para construir una hélice alfa y una lámina beta

animación Biomodel: animaciones de los niveles estructurales en proteínas y del efecto hidrófobo

Biomodel-1: estructuras secundarias: hélice alfa, hebras beta, láminas beta, hélice del colágeno

Contenidos relacionados:

Práctica 1: Cromatografía de exclusión molecular (o filtración en gel). (También con tema 5)

Práctica 3: Identificación de las diferentes isoformas de la LDH mediante electroforesis en acetato de celulosa. (También con tema 7)

más Tema 5 - Mioglobina y hemoglobina

Estructura, propiedades y función biológica de la mioglobina y la hemoglobina. Mecanismo de unión al oxígeno. Cambios en la conformación. Conceptos de alostería y cooperatividad. Moduladores de la función de la hemoglobina.

Contenidos relacionados:

Práctica 1: Cromatografía de exclusión molecular (o filtración en gel). Interconversión de las formas de la hemoglobina.

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 7, p. 146-148

Biomodel-1: hemoglobina

página Modelos animados de la transición entre conformaciones T y R (en animaciones de Biomodel)

más Tema 6 - Enzimas: conceptos básicos y cinética

Definición, características y clasificación. Mecanismos de la catálisis enzimática. Especificidad. Cinética enzimática. Modelo de Michaelis y Menten. Parámetros cinéticos: Vmáx, Km y kcat. Factores que modifican la actividad enzimática. Inhibidores: tipos y características. Estrategias catalíticas.

8, 9, 12, 13◤ febrero

Conceptos a adquirir:

resumen de conceptos clave (temas 6 y 7 conjuntamente)

Guía de los contenidos: página

Contenidos relacionados:

Práctica 4: Estudio cinético de la fosfatasa alcalina.

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 8

McKee, cap. 6, hasta p. 197

página Esquemas animados sobre diversos aspectos de la acción enzimática (Biomodel)

Biomodel > metabolismo > enzimas

Ejercicios y actividades de estudio:

más Tema 7 - Regulación de la actividad enzimática

Regulación por cambios en la concentración de enzima. Regulación de la eficacia catalítica: alostería, modificaciones covalentes. Isoenzimas.

13◢, 14, 15◤ febrero

Conceptos a adquirir:

resumen de conceptos clave (temas 6 y 7 conjuntamente)

Guía de los contenidos:

Contenidos relacionados:

Práctica 3: Identificación de las diferentes isoformas de la LDH mediante electroforesis.

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 8, p. 177ss

McKee, cap. 6, desde p. 197

libros de bioquímica en general

Activación por ruptura proteolítica: Texto ilustrado e interactivo de biología molecular, cap. 22 y su material en web material

Alostería:

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios para afianzar los conceptos de actividad enzimática, concentración de actividad enzimática y actividad enzimática específica.

página Ejercicios sobre los contenidos de temas 6 y 7, incluidas sus respuestas.

pdf Más ejercicios y sus respuestas.

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación 8-1 a 8-4 y los adicionales
Actividades interactivas 8-1 a 8-5b

Seminario, temas 6 a 8

23 febrero grupo A, 27 febrero grupo B

Hoja de problemas

más Tema 8 - Glúcidos

Características generales y clasificación. Monosacáridos, disacáridos. Enlaces glicosídicos. Polisacáridos: estructura y función. Glucoconjugados.
+ parte del tema 2 (estructura y enlaces de nucleósidos y nucleótidos)

15◢, 16, 19, 20 febrero

Conceptos a adquirir:

resumen de conceptos clave

Guía de los contenidos: página

Contenidos relacionados:

Prácticas 5+6: Aislamiento y cuantificación del glucógeno hepático en situación de ayuno y alimentación. (También con tema 15)

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 2

McKee, cap. 7, hasta p. 231

Puedes utilizar cualquier libro de texto.

Modelos moleculares de glúcidos (en Biomodel) Consulta la página "guía de contenidos" de este tema.

Ejercicios y actividades de estudio:

pdfCrucigrama de terminología. Respuestas

página Ejercicios de glúcidos. (con respuestas)

página Ejercicios de nomenclatura de glúcidos. (con autoevaluación)

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Ejercicio 2-1 y los adicionales.
Preguntas de autoevaluación 2-1, -2 y -4 y casi todas las adicionales (1, 3, 5 a 9, 11, 14 a 16, 19 a 29, 33 a 35, 38 a 44).

Actividades interactivas 2-1 a 2-3. (atención: la 2.1 tiene errata).

más Tema 2 - Ácidos nucleicos. 1ª parte: Nucleósidos y nucleótidos. Enlaces N-glicosídico y fosfodiéster

Tipos y composición química: DNA y RNA. Bases purínicas y pirimidínicas. Nucleósidos y nucleótidos. La doble hélice del DNA. Métodos de estudio. Secuenciación.

T: 19 febrero

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 5

McKee, cap. 17: pp. 554-559, 579-583.

Biomodel-3: bases, nucleósidos y nucleótidos

Biomodel-1: DNA y RNA

Texto ilustrado e interactivo de biología molecular información del libro caps.1.2, 1.3.1; 2; 3; 4.3

animación Biomodel: Vistas con animación de la molécula de DNA en doble hélice

Ejercicios y actividades de estudio:

más Tema 9 - Lípidos

Ácidos grasos: estructura, nomenclatura, clasificación. Lípidos de almacenamiento. Lípidos estructurales. Lípidos con otras actividades biológicas.

21, 22, 23 febrero

Conceptos a adquirir:

resumen de conceptos clave

Guía de los contenidos:

Contenidos relacionados:

prácticaPráctica 2: Extracción de lípidos y separación por cromatografía en capa fina.

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 3

McKee, cap. 11, hasta p. 359

Estructuras 3D en Biomodel-3

Biomodel-2 > “El mundo de los lípidos

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios sobre familas de lípidos: estructura y polaridad (con autoevaluación)

página Ejercicios de lípidos y membranas (con autoevaluación)

página Ejercicios sobre polaridad de los lípidos: separación mediante cromatografía

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Ejercicio 3-1 y todos los adicionales.
Preguntas de autoevaluación 3-1 a 3-4 y casi todas las adicionales.

Actividades interactivas 3-1 a 3-7.

página (ampliación) "Casos": temas para discusión crítica y conexión con la vida cotidiana (hay otros en “El mundo de los lípidos”)

más Tema 10 - Membranas biológicas y transporte

Composición química y estructura de las membranas. Fluidez de membrana. Transporte de solutos a través de las membranas: difusión simple, difusión facilitada, transporte activo, ionóforos y canales iónicos. Papel de la membrana plasmática en la señalización celular.

26, 27 febrero

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 4 y cap. 9 p.190-193

McKee, cap. 11, p. 361-369, 532-533 (GPCR), 535-536 (receptor tirosina-quinasa)

Biomodel-2 > Bicapa lipídica

Biomodel-2 > “El mundo de los lípidos” > Bicapas

Ejemplo de proteína transportadora a través de la membrana en Biomodel > Metabolismo

Ejercicios y actividades de estudio:

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación 4-1 a 4-3 y las adicionales 1 a 6.

pdfDistribución de aminoácidos en las proteínas de membrana (página original: MemProtMD; licencia CC-by)

más Tema 11 - Introducción al metabolismo

Ciclo de materia y flujo de energía a través de la biosfera. Visión general del metabolismo: anabolismo y catabolismo. Bioenergética. Compuestos con enlaces ricos en energía. Oxidorreducción biológica y sistemas de transporte electrónico. Fosforilación oxidativa y fotofosforilación.

28 febrero, 1, 2, 3 marzo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Bioenergética:

Feduchi, cap. 10

McKee, cap. 4, desde p. 98.

Redox:

McKee, cap. 9, p. 280-285.

Transporte electrónico y fosforilación oxidativa:

página Biomodel > Metabolismo > Transporte electrónico mitocondrial

cap. 12, p. 284-288 (muy simplificado, hay que complementarlo) Correcciones al texto de Feduchi.

McKee, cap. 10 hasta p. 321. Correcciones al texto de McKee.

sonido“Canción de la mitocondria” - programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa) 3 min

sonido“Mr. W's Electron Transport Chain” - vídeo + rap en inglés con subtítulos en inglés

vídeo Electron Transport Chain - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University

vídeo ATP synthase (gradients) - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University

vídeo Otras animaciones simples en Biomodel (en la parte inferior de la página)

Fotofosforilación:

página Biomodel > Metabolismo > Transporte electrónico fotosintético

McKee, cap. 13, p. 431-435, 440-444 (excesivo detalle).

vídeo Photosynthesis (The Light Reactions) - Virtual Cell Animation Collection, North Dakota State University

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios de introducción al metabolismo, bioenergética, redox. (con respuestas)

Ejercicio con autoevaluación: orden de los transportadores de electrones páginaen mitocondria y páginaen cloroplasto.

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Ejercicio 10-1 y los adicionales 2 a 5.
Preguntas de autoevaluación 10-1 y las adicionales 2, 3, 5, 6, 7, 18.

más Tema 12A - La glucosa en el metabolismo

(12A) Papel central de la glucosa en el metabolismo.

14◤ marzo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: pdf

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 15, p. 357-359.

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Pregunta de autoevaluación 15-2.

más Tema 12B - Glucólisis

(12B) Glucólisis: características, reacciones, balance energético y regulación.

14◢, 15◤ marzo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 11, p. 254-258.

McKee, cap. 8, p. 240-249, 251-254.

En Biomodel:

  • abrir web ruta metabólica
  • Incluye  modelo molecular de la hexoquinasa con animación del ajuste inducido.
  • Otra animación de ajuste inducido, con el ejemplo de la acción catalítica de la hexoquinasa. University of California at Santa Barbara

sonido“Mr. W's Glycolysis Rap” - vídeo musical en inglés con subtítulos en inglés

sonido Repaso de las reacciones, musical: Rap de glucólisis (proyecto escolar "Rap Medicina", 4,5 min) ¡Ojo! debe ser bisfosfato, no bifosfato

Ejercicios y actividades de estudio:

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación 11-2, 11-3 y 11-4, y adicional 11-2.

Ejercicios: conjuntos con el tema 14.

más Tema 14 - Gluconeogénesis

Reacciones y balance energético. Sustratos gluconeogénicos. Regulación coordinada de la glucólisis y la gluconeogénesis.

15◢, 17, 18 marzo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 11, p. 258-262.

McKee, cap. 8, p. 255-262.

abrir web ruta metabólica en Biomodel (abrir webgluconeogénesis). Incluye detalles de la regulación mediante Fru-2,6P2 y de las reacciones de la piruvato carboxilasa y PEP carboxiquinasa.

mostrar respuestas de las "fichas" de la Fru-2,6P2

Conexión con temas anteriores:

  • Regulación de enzimas por alostería (PFK)

Animaciones:  (para repaso o ampliación)

  • _1_ Boyer's Interactive Concepts in Biochemistry - Wiley (en inglés)
    En especial, hay una autoevaluación interesante en el enlace "Interactive" a la derecha.
  • _2_en nueva ventana Acción de la enzima bifuncional PFK2 / FBPasa2 (Biochemistry of Metabolism - Joyce J. Diwan, Rensselaer Polytechnic Institute, Troy, NY USA) (requiere Shockwave Player)

sonido Rap del ciclo de Cori (proyecto escolar "Rap Medicina", 3:14 min) ¡Ojo! hay un NADPH que debe ser NADH

Ejercicios y actividades de estudio (glucólisis 12B, gluconeogénesis 14 y piruvato 12C):

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación 11-2, 11-3 y 11-4, y adicionales 11-1 a 11-6. Actividad interactiva 11-2.

páginaEjercicios nº 1 (principalmente glucólisis)

páginaEjercicios nº 2 (principalmente gluconeogénesis)

páginaEjercicios nº 3 (principalmente destinos del piruvato)

pdfEjercicio nº 4, crucigrama (glucólisis + gluconeogénesis) para repasar enzimas y metabolitos. Respuestas.

páginabalance y páginamoléculas - Ejercicios nº 5 (colocar en la ruta) en Biomodel Metabolismo

más Tema 12C - Destino del piruvato

(12C) Destinos del piruvato en condiciones anaerobias: Fermentaciones láctica y alcohólica. Descarboxilación oxidativa del piruvato.

21, 22 marzo (día 24 repaso y ejercicios)

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 11, p. 262-266.

McKee, cap. 8, p. 249-251

Destinos metabólicos del piruvato (anaeróbicos):

  • abrir web ruta en Biomodel: fermentaciones
  • páginaSimulador para observar cómo las isoenzimas de la lactato deshidrogenasa tienen una abundancia diferente en cada tejido. (Material accesorio, útil para las prácticas)

Destinos metabólicos del piruvato (aeróbicos):

  • abrir web ruta en Biomodel: descarboxilación oxidativa (anexo al ciclo de Krebs) y detalles
  • abrir web Relaciones entre diversos metabolitos: parentesco estructural.
  • Animaciones de las reacciones del complejo de la piruvato deshidrogenasa:
    • mostrar Animación de estructura y reacciones. Con una representación más realista de la estructura del complejo PDH. (ChemgaPedia, Wiley; ubicación original)
    • mostrar Estructura del complejo, resaltando los brazos flexibles que portan el sustrato. (Smart Biology)

Ejercicios y actividades de estudio:

Véase tema 14 ↑

más Tema 13 - Ciclo de los ácidos tricarboxílicos (ciclo del ácido cítrico o de Krebs)

Papel central del ciclo de Krebs en el metabolismo. Reacciones, rendimiento energético y regulación. Lanzaderas de malato-aspartato y de glicerol-3-fosfato. Naturaleza anfibólica del ciclo. Reacciones anapleróticas.

28, 29, 30 marzo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 12, p. 275-284, 289-290.

McKee, cap. 9, p. 287-301.

abrir web ciclo de Krebs en Biomodel - referencia principal para la ruta en su conjunto y las características globales

abrir web Lanzaderas citosol ↔ mitocondria y translocasa de ATP y ADP, en Biomodel

 pdfesquema maestro del ciclo (reacciones, enzimas y estructuras); será la referencia principal para los detalles

mostrar Estructura de las enzimas del ciclo. (Smart Biology)

Animaciones de las reacciones del ciclo de Krebs:

  • _A_ Animación. (Carmen Monge García-Moreno, Proyecto Biosfera)
  • _B_ Estupenda animación del ciclo en resumen y en detalle (Leopoldo de Meis y col.) En portugués, pero se entiende bien.

Lecciones en vídeo sobre el ciclo:

  • Resumen de las características globales del ciclo y su conexión con otras rutas (Christian Villanueva, "La Biología te Hará Libre", 9 min) Muy recomendable
  • sonido“Mr. W's Krebs Cycle” - vídeo musical en inglés con subtítulos en inglés
  • Repaso de las reacciones, musical: Rap del ciclo de Krebs (proyecto escolar "Kontrol Krebs", 4 min)
  • Repaso de las reacciones, musical: Rap del ciclo de Krebs (proyecto escolar "Rap Medicina", 2,5 min) ojo con los balances de ATP; el ATP no se produce en el ciclo, sino posteriormente en el transporte electrónico + fosforilación oxidativa; y, en lugar de 3, 3 y 2 ATP deben ser 2'5, 2'5 y 1'5 moléculas.

Otras animaciones del ciclo de Krebs:  (para repaso o ampliación) Todas utilizan el formato Flash, por lo que puede haber dificultad para verlas dependiendo del navegador.

  • _1_ Animaciones de biología celular de John Kyrk (en español)
  • _2_ Biology 203 Cell Biology Laboratory, Graham Kent, Smith College, Northampton, MA, USA. (en inglés)
  • _3_ Seeley's Anatomy & Physiology - McGraw Hill Online Learning Center. (en inglés)
  • _4_ Boyer's Interactive Concepts in Biochemistry - Wiley (en inglés)

abrir vídeo Balance energético del ciclo. Vídeo que explica el razonamiento y el cálculo (4 min) (Nótese que en su desarrollo se usan las cifras antiguas de producción de ATP en fosforilación oxidativa: 3 por cada NADH y 2 por cada FADH2, en lugar de las cifras actualizadas de 2,5 y 1,5; por lo demás, todo el razonamiento es correcto)

Ejercicios y actividades de estudio:

  • Ejercicios para aprender el ciclo, con autoevaluación:
    • balance de carbono, redox y energía
    • nombres de metabolitos y enzimas
    • estructuras de metabolitos
  • Ejercicios (preguntas de opción múltiple con autoevaluación).

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación 12-1 a 12-4, y adicionales 1 a 4, 10 a 12. Actividades interactivas 12-1-2 y 12-1-3 .

más Tema 15 - Metabolismo del glucógeno

Funciones del glucógeno en músculo e hígado. Degradación y biosíntesis. Regulación coordinada de la degradación y la biosíntesis.

T: 31 marzo, 4 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 11, p. 268-272. Tiene lo más básico; para la regulación hace falta ampliarlo con nuestra "guía de contenidos"

McKee, cap. 8, desde p. 268.

abrir web ruta metabólica en Biomodel (abrir webglucogenogénesis y abrir webglucogenólisis)

abrir webresumen de la regulación hormonal de síntesis y degradación del glucógeno

Ejercicios y actividades de estudio:

Ejercicios nº 1 (preguntas con autoevaluación).

Ejercicios nº 2 (preguntas de opción múltiple con autoevaluación).

Ejercicios nº 3 (problema con autoevaluación).

Ejercicios nº 4 (problema con autoevaluación).

páginanombres y páginaestructuras - Ejercicios nº 5 (colocar en la ruta) en Biomodel Metabolismo

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación adicionales 11-9 y 11-10.

+ Tema 16 - Ruta de las pentosas-fosfato y fijación fotosintética del dióxido de carbono

Vía de las pentosas-fosfato: significado biológico y estrategia global. Fase oxidativa y fase no oxidativa. Regulación de la ruta. Ciclo de Calvin: fases, reacciones y regulación.

T: 5, 6, 7 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 11, p. 266-268. No tiene nada del ciclo de Calvin.

McKee, cap. 8, p. 262-266 y cap. 13, p. 446-449.

abrir web ruta en Biomodel: abrir webruta de las pentosas-fosfato; abrir web asimilación del C

Definición de transaldolasa y transcetolasa en la Comisión de Enzimas.

Balance para la oxidación completa de glucosa a través de la ruta de las pentosas.

Ciclo de Calvin:

abrir web Esquema animado por etapas para comprender el ciclo: reposición de la ribulosa-bisfosfato consumida por la rubisco.

Animaciones:  (para repaso o ampliación)

animación Biology 203 Cell Biology Laboratory, Graham Kent, Smith College, Northampton, MA, USA. (en inglés)

sonido“Carrusel metabólico, 1ª parte”- programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa)

sonido“Carrusel metabólico, 2ª parte”- programa radiofónico de La Bicicleta de Krebs (UMa)

Ejercicios y actividades de estudio:

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Preguntas de autoevaluación adicionales 11-7 y 11-8.

páginaEjercicios nº 1 (problemas; son entretenidos de hacer pero no deberíais tener dificultad consultando los apuntes de clase o la bibliografía; incluye autoevaluación).

páginaEjercicios nº 2 (preguntas de opción múltiple con autoevaluación).

+ Tema 17 - Lipólisis y oxidación de ácidos grasos
Tema 18 - Biosíntesis de lípidos (lipogénesis)

Hidrólisis de los triacilgliceroles. Regulación. Destino de los productos de la lipólisis. Activación y entrada de ácidos grasos a la mitocondria. Beta-oxidación de los ácidos grasos: reacciones, balance energético y regulación. Metabolismo de los cuerpos cetónicos.
Síntesis de ácidos grasos: complejo de la ácido graso sintasa, reacciones y regulación. Biosíntesis de triacilgliceroles.

T: 10, 11, 15, 16, 17 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Contenidos temas 17 y 18 combinados y reordenados: abrir pdf

abrir web Ruta de beta-oxidación y abrir web Ruta de síntesis de ácidos grasos en Biomodel

Dos elementos animados esenciales para comprender la biosíntesis:

  1. abrir vídeoacción secuencial de los centros catalíticos de la sintasa de ácidos grasos y la intervención de la ACP (en esta web)
  2. abrir webmecanismo de actuación de la sintasa en sucesivas elongaciones (en Biomodel, metabolismo integrado, síntesis de ácidos grasos)

abrir web Sales biliares y ácidos biliares

abrir web Lipoproteínas

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 13, p. 297-298, 302-314..

McKee, cap. 12 pp.373-386 (bueno por lo resumido).

abrir vídeo Visión general del metabolismo de lípidos. Introducción informal a la degradación y síntesis de grasas (vídeo, 2 min)

abrir web La entrada de los ácidos grasos a la mitocondria, explicada con animaciones (en inglés)

abrir vídeo Beta-oxidación de los ácidos grasos. En formato de relato: contexto metabólico, presentación y reacciones (vídeo, 6 min)

abrir vídeo Balance energético de la beta-oxidación. Vídeo que explica el razonamiento y el cálculo (5 min) (Nótese que en su desarrollo se usan las cifras antiguas de producción de ATP en fosforilación oxidativa: 3 por cada NADH y 2 por cada FADH2, en lugar de las cifras actualizadas de 2,5 y 1,5; por lo demás, todo el razonamiento es correcto)

abrir web Esquema animado de las reacciones de la sintasa de ácidos grasos. Voet, 3ª ed.

abrir web La sintasa de ácidos grasos: estructura y reacciones. Complemento animado. Material de P. Roca y J. Oliver, UIB

Ácidos grasos "omega menos 3" y "omega menos 6":

Algunas lecturas para quien quiera profundizar en este tema:

Ejercicios y actividades de estudio:

Crucigramas: Degradación abrir pdf Biosíntesis abrir pdf

No corresponden a lo que se espera de un examen, sino que es una forma de practicar y repasar lo que debéis estudiar.

  Respuestas Respuestas

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Ejercicio 13-1. Preguntas de autoevaluación 13-2, 13-3. Actividad interactiva 13-1. Actividad interactiva 13-2 (p.308) Preguntas de autoevaluación 1

abrir Ejercicios sobre catabolismo de ácidos grasos (con autoevaluación)

Ejercicios sobre biosíntesis de ácidos grasos (con autoevaluación)

Ejercicios sobre absorción, transporte y metabolismo de triacilgliceroles y sobre cuerpos cetónicos (con autoevaluación)

+ Tema 17 - Lipólisis y oxidación de ácidos grasos

Hidrólisis de los triacilgliceroles. Regulación. Destino de los productos de la lipólisis. Activación y entrada de ácidos grasos a la mitocondria. Beta-oxidación de los ácidos grasos: reacciones, balance energético y regulación. Metabolismo de los cuerpos cetónicos.

T: 19, 20, 21 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

abrir web Sales biliares y ácidos biliares

abrir web Lipoproteínas

abrir web Ruta de beta-oxidación en Biomodel

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 13, p. 297-298, 302-306, 310-313.

McKee, cap. 12 pp.373-386 (bueno por lo resumido).

abrir vídeo Visión general del metabolismo de lípidos. Introducción informal a la degradación y síntesis de grasas (vídeo, 2 min)

abrir web La entrada de los ácidos grasos a la mitocondria, explicada con animaciones (en inglés)

abrir vídeo Beta-oxidación de los ácidos grasos. En formato de relato: contexto metabólico, presentación y reacciones (vídeo, 6 min)

abrir vídeo Balance energético de la beta-oxidación. Vídeo que explica el razonamiento y el cálculo (5 min) (Nótese que en su desarrollo se usan las cifras antiguas de producción de ATP en fosforilación oxidativa: 3 por cada NADH y 2 por cada FADH2, en lugar de las cifras actualizadas de 2,5 y 1,5; por lo demás, todo el razonamiento es correcto)

Ejercicios y actividades de estudio:

Crucigrama: abrir pdf No corresponde a lo que se espera de un examen, sino que es una forma de practicar y repasar lo que debéis estudiar. Respuestas

abrir Ejercicios sobre catabolismo de ácidos grasos (con autoevaluación)

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Ejercicio 13-1. Preguntas de autoevaluación 13-2, 13-3. Actividad interactiva 13-1

+ Tema 18 - Biosíntesis de lípidos (lipogénesis)

Síntesis de ácidos grasos: complejo de la ácido graso sintasa, reacciones y regulación. Biosíntesis de triacilgliceroles.

T: 25, 26 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

Dos elementos animados esenciales para comprender este tema:

  1. abrir vídeoacción secuencial de los centros catalíticos de la sintasa de ácidos grasos y la intervención de la ACP (en esta web)
  2. abrir webmecanismo de actuación de la sintasa en sucesivas elongaciones (en Biomodel, metabolismo integrado, síntesis de ácidos grasos)

abrir web Ruta de síntesis de ácidos grasos en Biomodel

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 13, p. 306-310, 313-314.

abrir web Esquema animado de las reacciones de la sintasa de ácidos grasos. Voet, 3ª ed.

abrir web La sintasa de ácidos grasos: estructura y reacciones. Complemento animado. Material de P. Roca y J. Oliver, UIB

Ácidos grasos "omega menos 3" y "omega menos 6":

Algunas lecturas para quien quiera profundizar en este tema:

  • Los ácidos grasos omega−3 y omega−6: nutrición, bioquímica y salud. M. Coronado Herrera et al. (2006) REB, Revista de Educación Bioquímica 25, 72-79 [En línea]
  • Ácidos grasos omega−3: pescados de carne azul y concentrados de aceites de pescado. Lo bueno y lo malo. A. Nasiff-Hadad y E. Meriño-Ibarra (2003) Revista Cubana de Medicina 42, 49-55 [En línea]
  • Ácidos grasos ω−3 y ω−6. En “El mundo de los lípidos” (sede web Biomodel). I. Carrero y A. Herráez. [En línea]
  • Síntesis de los ácidos grasos ω−3 y ω−6. En “El mundo de los lípidos” (sede web Biomodel). I. Carrero y A. Herráez. [En línea]

Ejercicios y actividades de estudio:

abrir pdfCrucigrama El crucigrama no corresponde a lo que se espera de un examen, sino que es una forma de practicar y repasar lo que debéis estudiar. Respuestas

Ejercicios sobre biosíntesis de ácidos grasos (con autoevaluación)

Ejercicios sobre absorción, transporte y metabolismo de triacilgliceroles y sobre cuerpos cetónicos (con autoevaluación)

Ejercicios en el texto de Feduchi:
Actividad interactiva 13-2 (p.308) Preguntas de autoevaluación 1

+ Metabolismo nitrogenado
Tema 19 - Degradación de aminoácidos
Tema 20 - Síntesis de aminoácidos

Reacciones generales del catabolismo de aminoácidos: transaminación, desaminación y descarboxilación. Destino y transporte del grupo amino. Ciclo de la urea: reacciones y regulación. Destinos del esqueleto carbonado de los aminoácidos.
Fijación del nitrógeno. Incorporación de nitrógeno amónico a esqueletos carbonados: síntesis de carbamil-fosfato, glutamato y glutamina. Aspectos generales de la biosíntesis de aminoácidos.

T: 18, 22, 23 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

abrir web ruta en Biomodel (ciclo de la urea, principales reacciones de intercambio de nitrógeno, transporte del nitrógeno entre tejidos)

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 14, p.327-336.

McKee, cap. 14.1 y 14.2 (p. 461-465, 467-470) y 15.2 (p.505-510).

abrir vídeo Oda a la urea

Canción sobre el ciclo de la urea, en tono informal (vídeo, 1:40 min)

sonido Repaso de las reacciones, musical: Rap del ciclo de la urea (proyecto escolar "Rap Medicina", 3 min)

abrir vídeo Ciclo de la urea narrado.

Lección narrada sobre el ciclo de la urea. (vídeo, 2:53 min). Danilo Salazar

abrir vídeo Otra narración del ciclo de la urea (vídeo, 5 min)

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicio sobre transaminación.

abrir web Crucigrama sobre catabolismo de aminoácidos (versión para resolver en pantalla); el mismo en versión para imprimirabrir pdf
          Resuelto: abrir pdf

página Preguntas con autoevaluación, nº1. (Catabolismo de aminoácidos)

página Preguntas con autoevaluación, nº2. (Fijación del N y biosíntesis de aminoácidos)

más Tema 2B - Ácidos nucleicos, 2ª parte: Estructura primaria y secundaria. Estructura de los tRNA. Métodos de estudio. Secuenciación.

La doble hélice del DNA. Métodos de estudio. Secuenciación. + Tipos y estructura de los RNA.

T: 24, 29 abril

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos:

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, cap. 5

McKee, cap. 17: pp. 554-559, 579-583.

Biomodel-3: bases, nucleósidos y nucleótidos

Biomodel-1: DNA y RNA

Texto ilustrado e interactivo de biología molecular información del libro caps.1.2, 1.3.1; 2; 3; 4.3

animación Biomodel: Vistas con animación de la molécula de DNA en doble hélice

Ejercicios y actividades de estudio:

+Tema 21 - Replicación y transcripción del DNA
(Biosíntesis de ácidos nucleicos)

Flujo de información génica. Características generales de la replicación: etapas y enzimas implicadas. Proceso de transcripción. RNA polimerasas.
Modificaciones postranscripcionales.

T: 30 abril, 6, 7◤ mayo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

Bibliografía y material de apoyo:

Feduchi, p. 372; cap.17, pp. 395-407 y Cap.18, pp. 418-424.

McKee, cap.18, pp. 593-600, 623-625, 627-628 (selección de las partes adecuadas)

Herráez, cap. 1, 11, 17, 19 (selección de las partes adecuadas)

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios (con respuesta).

+Tema 22 - Biosíntesis de proteínas

El código genético. Proceso de traducción. Modificaciones postraduccionales.

T: 7◢, 8, 9 mayo

Conceptos a adquirir:

conceptos clave (resumen)

Guía de los contenidos: abrir pdf

Bibliografía y material de apoyo:

Diagrama circular del código genético, interactivo y para imprimir (pdf) (en Biomodel)

Esquema en etapas del progreso de la elongación (paso de los aminoacil-tRNA por el ribosoma y crecimiento del polipéptido).

Feduchi, Cap.18, pp. 427-433.

McKee, Cap.19, pp. 650-663, 665-670. (selección de las partes adecuadas)

Herráez, cap. 20,21 (selección de las partes adecuadas)

sonido“Mr. W's Protein Synthesis” - vídeo musical en inglés con subtítulos en inglés

Vídeos sobre estructura del ribosoma y mecanismo de la traducción:

animación1 animación2 - del laboratorio de Martin Schmeing   animación3 - del laboratorio de Venki Ramakrishnan

Ejercicios y actividades de estudio:

página Ejercicios de uso y comprensión del código genético (con respuestas).

página Ejercicios sobre la biosíntesis de proteínas (con respuestas).

... El resto de temas se irán publicando progresivamente ...